Dziedziny zainteresowań: biologia obliczeniowa i bioinformatyka ze szczególnym uwzględnieniem algorytmiki, optimalizacji kombinatorycznej i teoretycznych własności drzew i sieci. W szczególności:

• uzgadnianie drzewa genów i gatunków,


• rekonstrukcja drzewa/sieci ze zbioru drzew genów,


• modelowanie scenariuszy ewolucyjnych,


• horyzontalny transfer genów,


• duplikacje genomowe,


• metagenomika,


• metody bootstrappingu,


• i matematyczne własności funkcji porównujących drzewa i sieci.

Fields: computational biology and bioinformatics with the focus on algorithms, combinatorial optimization and theoretical properties of models of trees and networks. In particular the main topics cover:

• tree reconciliation of gene tree and species tree,


• inference of a species tree or a network from gene trees,


• modelling evolutionary scenarios,


• inference of horizontal gene transfers,


• inference of genomic duplications,


• metagenomics,


• bootstrapping methods for trees and networks,


• and mathematical properties of tree/network comparison functions.

Kierownik grantów NCN:

• #2017/27/B/ST6/02720 Koherentne Modele i Wydajne Algorytmy dla Duplikacji Genomowych (2018-2021)


• #2019/33/B/ST6/00737 Biologicznie Znacząca Rekonstrukcja Sieci Filogenetycznych (2020-2023)

• #2015/19/B/ST6/00726 Genomika Obliczeniowa: Problemy, Algorytmy i Modele (2016-2020)

Currently, I am project manager of NCN grants:

• #2017/27/B/ST6/02720 Consistent Models and Efficient Algorithms for Genomic Duplications (2018-2021)


• #2019/33/B/ST6/00737 Biologically Meaningful Inference of Phylogenetic Networks (2020-2023)

• #2015/19/B/ST6/00726 Computational Genomics: Problems, Algorithms and Models (2016-2020)