dr hab. Iwona Jasser profesor uczelni
Wydział Biologii
Field of study:
Earth and related environmental sciences, biological sciences
Zainteresowania badawcze:
Moje zainteresowania dotyczą występowania, właściwości ekofizjologicznych i różnorodności cyjanobakterii z różnych środowisk, w tym środowisk ekstremalnych. Interesują mnie pikocyjanobakterie, dominujące liczebnie w planktonie oceanów oraz duże, planktonowe i denne sinice tworzące zakwity i maty mikrobialne. Badania prowadzę w różnych środowiskach, od wodnych (j. mazurskie, M. Bałtyckie), przez środowiska graniczne (maty mikrobialne płytkich zbiorników i strumieniach), po lądowe (biologiczne skorupy glebowe) w środowiskach pustynnych (Pamir Wsch., Kalifornia Pd.). Interesuje mnie ewolucja, filogeneza, taksonomia, biogeografia i toksyczność sinic. Badam występowanie zakwitów sinicowych i cyjanotoksyn, metody walki z zakwitami, inwazyjne sinice w Polsce i wpływ klimatu na zespoły sinic. Stosuję metody mikroskopowe, izolacje i hodowle sinic, klasyczne analizy genetyczne i badania metagenomu środowiskowego metodą sekwencjonowania nowej generacji.
description of research interests:
My research interests relate to the ecology, occurrence, ecophysiology and diversity of cyanobacteria from various environments, including extreme ones. I am interested in picocyanobacteria, abundant in ocean plankton, and large planktonic and benthic cyanobacteria forming blooms and microbial mats. I conduct research in various environments, from aquatic (Mazurian Lakes, Baltic Sea), through border environments (microbial mats in shallow pools and streams) to terrestrial (biological soil crusts) in arid regions (Eastern Pamir, Southern California). I am interested in evolution, phylogeny, taxonomy, biogeography and toxicity of cyanobacteria. I study occurrence of cyanobacterial blooms and cyanotoxins in various conditions, blooms’ mitigation methods, invasive cyanobacteria in Poland and climate change impact on cyanobacteria. I use microscopic analyses, isolation and culturing methods, classic genetic and environmental metagenome studies with next generation sequencing (NGS).
Realizowane projekty:
„Różnorodność toksycznych i nietoksycznych szczepów cyjanobakterii w matach cyjanobakteryjnych i skorupach glebowych w ekstremalnych środowiskach – podejście metagenomowe”. Celem projektu jest rozpoznanie różnorodności gatunkowej sinic występujących w warunkach ekstremalnych, zbadanie potencjału sinic do produkcji toksyn i rzeczywistej produkcji toksyn oraz ustalenie czy geny toksyczności podlegają pozytywnej selekcji. Badania prowadzone są na górskiej pustyni w Pamirze Wschodnim i depresyjnej pustyni Południowej Kalifornii. Projekt łączy badania środowiskowe, ekologiczne, biogeochemiczne, biochemiczne i genetyczne. Główną część stanowią badania metagenomowe z wykorzystaniem sekwencjonowania nowej generacji (NGS) amplikonu środowiskowego i całych metagenomów a następnie analizy bioinformatyczne wyników. Badania pozwalają również na izolację nowych taksonów i szczepów o biotechnologicznym potencjale
research projects implemented:
Current project "Diversity of toxic and non-toxic cyanobacterial strains in cyanobacterial mats and soil crusts in extreme environments – a metagenomic approach". The aim of the project is to recognize the species diversity of cyanobacteria in extreme conditions, to investigate the potential of cyanobacteria for toxin production and actual toxin production, and to determine whether the toxicity genes are under of positive selection. The study is conducted in the mountain desert of the Eastern Pamir and the depressive desert of Southern California. The project combines environmental, ecological, biogeochemical, biochemical and genetic research. Main part of the project is covered by metagenomic research using next generation sequencing (NGS), environmental amplicon and whole metagenomes, followed by bioinformatic analysis of the results. The research in the understudied environment allows also for isolation of new cyanobacterial taxa and strains with biotechnological potential.
Słowa kluczowe:
analizy metagenomowe, cyjanobakterie, cyjanotoksyny, ekofizjologia sinic, NGS, pikocyjanobakterie, taksonomia sinic, zakwity sinicowe,
Key words:
cyanobacteria, cyanobacterial blooms, cyanobacterial ecophysiology, cyanobacterial taxonomy, cyanotoxins, metagenomic analyses, NGS, picocyanobacteria
Contact:
Odnośniki:
Links:
« Back