Struktura, właściwości i molekularne aspekty funkcjonowania ruchomych elementów genetycznych bakterii. Rola mobilomu w determinowaniu zmienności i w ewolucji bakterii. Adaptacja bakterii do zmiennych warunków środowiska. Mechanizmy odpowiadające za szerzenie się zjawiska antybiotykooporności i generowanie fenotypów wieloopornych bakterii – w środowisku naturalnym i klinicznym. Mechanizmy regulacji ekspresji genów. Genomika bakterii, w tym patogenów oportunistycznych i wielolekoopronych szczepów bakterii patogennych.

Structure, properties and molecular aspects of the functioning of bacterial mobile genetic elements. The role of the mobilome in determining variability and in bacterial evolution. Adaptation of bacteria to changing environmental conditions. Mechanisms responsible for the spread of antibiotic resistance and the generation of multidrug resistant phenotypes in bacteria - in the natural and clinical settings. Mechanisms of regulation of gene expression. Genomics of bacteria, including opportunistic pathogens and multidrug-resistant strains of pathogenic bacteria.

Dynamika ewolucji transpozycyjnego rezystomu wielolekoopornych izolatów klinicznych Enterobacterales. Planujemy (a) skonstruowanie serii nowych narzędzi genetycznych, umożliwiających pozytywną selekcję zdarzeń transpozycji (a tym samym „wychwytywanie” i scharakteryzowanie in vivo funkcjonalnych elementów transpozycyjnych) oraz (b) wykorzystanie ich do przeprowadzenia dogłębnej analizy mobilomu transpozycyjnego wielolekoopornych, istotnych z klinicznego punktu widzenia bakterii chorobotwórczych z rodziny Enterobacteriaceae. Udomowianie mobilnego DNA - studium przypadku plazmidów wirulencji bakterii z rodzaju Cronobacter. Planujemy przeprowadzenie dogłębnej analizy plazmidów wirulencji bakterii z rodzaju Cronobacter. Replikony te towarzyszą temu rodzajowi taksonomicznemu przez cały okres jego historii ewolucyjnej. Rodzi to pytania o przyczyny i skutki (na poziomie fizjologicznym i molekularnym) tak długotrwałej asocjacji.

Evolutionaly dynamics of transposable resistome of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales. In this project we plan to (i) construct a series of novel genetic tools that enable positive selection of transposition events (and thus the in vivo “capture” and characterization of functional transposable elements) and (ii) use them to perform an in-depth analysis of the transposable mobilome of multidrug resitant, relevant pathogenic bacteria of the family Enterobacteriaceae. Domestication of mobile DNA – the case study of the virulence plasmids of bacteria of the genus Cronobacter. We plan an in-depth analysis of the virulence plasmids of bacteria of the genus Cronobacter. These replicons have accompanied the genus throughout its evolutionary history. This raises questions about the causes and consequences (at the physiological and molecular level) of such a long-term association.