Zajmuję się szeroko pojętą molekularną biologią obliczeniową. Głównym obszarem zainteresowań mojej grupy jest rozwój i zastosowanie metod obliczeniowych i statystycznych do badania mechanizmów regulacji ekspresji genów. W szczególności interesuje nas:

• analiza sekwencji regulatorowych w niekodującym DNA,


• analiza wiązania czynników transkrypcyjnych do tych sekwencji,


• przewidywanie interakcji obszarów chromosomowych oraz chromosomowych domen regulatorowych,


• analiza profili ekspresji genów secyficznych dla różnych warunków i tkanek,


• budowa modeli matematycznych i metod obliczeniowych do badania tych zjawisk.

I'm working on broadly defined molecular computational biology. The main area of research of my group is development and applying computational and statistical methods to understand the mechanisms of gene expression regulation. In particular, we are interested in:

• analysis of regulatory sequences in non-coding DNA,


• analysis of transcription factor binding to these sequences,


• prediction of chromosomal contacts and chromosomal regulatory domains,


• analysis of tissue- and condition-specific gene expression profiles,


• building mathematical models and computational methods for these tasks.

W ostatnich latach uczestniczyliśmy w wielu projektach naukowych finansowanych ze środków krajowych i zagranicznych, między innymi:

• "Food4thought: epigenomics of eating disorders" - European Grant with collaborators from Lisboa, Milan, Munich and Barcelona


• "An atlas of brain regulatory regions and regulatory networks - a novel systems biology approach to pathogenesis of selected neurological disorders" - NCN Symfonia Grant


• "Computational modeling of transcriptional regulation in the context of chromatin dynamics" - FNP Homing grant


• European Molecular Biology Organization Installation Grant

• "Defining (sex and age) cell-specific epigenetic mechanisms underlying Environmental Enrichment/Exercise as non-pharmacological intervention for Alzheimer’s and Huntington’s disease and related potential noninvasive biomarkers." finansowany w ramach programu JPND

We have been working on a number of collaborative research projects funded both by Polish and international agencies. Among others:

• "Food4thought: epigenomics of eating disorders" - European Grant with collaborators from Lisboa, Milan, Munich and Barcelona


• "An atlas of brain regulatory regions and regulatory networks - a novel systems biology approach to pathogenesis of selected neurological disorders" - NCN Symfonia Grant


• "Computational modeling of transcriptional regulation in the context of chromatin dynamics" - FNP Homing grant


• European Molecular Biology Organization Installation Grant

• "Defining (sex and age) cell-specific epigenetic mechanisms underlying Environmental Enrichment/Exercise as non-pharmacological intervention for Alzheimer’s and Huntington’s disease and related potential noninvasive biomarkers." financed under the JPND international programme