Laboratorium dr Kowalskiej na Wydziale Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego prowadzi interdyscyplinarne badania ukierunkowane na odkrywanie nowych funkcji nukleotydów, oligonukleotydów i kwasów nukleinowych w komórce i wykorzystywanie tej wiedzy do tworzenia nowych narzędzi molekularnych lub eksperymentalnych terapii. Aby osiągnąć ten cel, grupa projektuje odczynniki do modyfikacji kwasów nukleinowych, tworzy sondy molekularne do badania procesów związanych z nukleotydami oraz inhibitory tych procesów. Badania obejmują chemiczną lub chemoenzymatyczną syntezę nukleotydów i analogów kwasów nukleinowych oraz badanie ich oddziaływań z białkami i enzymami in vitro oraz w żywych komórkach za pomocą szerokiego wachlarza metod biofizycznych i biochemicznych, w tym spektroskopii absorpcyjnej i emisyjnej, jądrowego rezonansu magnetycznego małych cząsteczek i białek, krystalografii rentgenowskiej, spektrometrii mas, termoforezy w mikroskali i mikroskopii fluorescencyjnej. Zapraszamy studentów zainteresowanych interdyscyplinarnymi badaniami na pograniczu chemii, biologii i biofizyki.

Dr. Kowalska's laboratory at the University of Warsaw's Faculty of Physics conducts interdisciplinary research focused on discovering new functions of nucleotides, oligonucleotides and nucleic acids in the cell and using this knowledge to create new molecular tools or experimental therapies. To achieve this goal, the group is designing reagents for modifying nucleic acids, creating molecular probes to study nucleotide-related processes and inhibitors of these processes. Research involves the chemical or chemoenzymatic synthesis of nucleotides and nucleic acid analogs and the study of their interactions with proteins and enzymes in vitro and in living cells using a wide range of biophysical and biochemical methods, including absorption and emission spectroscopy, nuclear magnetic resonance of small molecules and proteins, X-ray crystallography, mass spectrometry, microscale thermophoresis and fluorescence microscopy.

Możliwe projekty/obszary badawcze:
-modyfikacje mRNA do zastosowań terapeutycznych
-opracowanie nowych metod syntezy nukleotydów i kwasów nukleinowych (w tym modyfikowanych analogów, znakowania fluorescencyjnego itp.)
-opracowanie testów do pomiaru interakcji białko-kwas nukleinowy, monitorowanie aktywności enzymatycznej, odkrywanie inhibitorów o potencjale terapeutycznym
-projektowanie i ocena nowych analogów nukleotydów o potencjalnym zastosowaniu badawczym i terapeutycznym
-badania metodami spektrometrii mas i NMR

Possible projects/research areas:
-modification of mRNA for theraputic applications
-developing new methods for the synthesis of nucleotides and nucleic acid (including modified analogs, fluorescent labelling etc)
-developing assays for measuring protein nucleic acid interaction, monitoring enzymatic activity, discovering inhibitors with therapeutic potential
-designing and evaluating novel nucleotide analogs with potential reasearch and therapeutic applications
-mass spectrometry and NMR studies