dr hab. Piotr Setny adiunkt

Centrum Nowych Technologii UW CeNT


Field of study:

chemical sciences, physical sciences

Zainteresowania badawcze:

Prowadzę grupę teoretyczną w Centrum Nowych Technologii (CeNT) Uniwersytetu Warszawskiego. Interesuje nas stosowanie modeli fizycznych do opisu i symulacji cząsteczek biologicznych w celu uzyskania wglądu w zasady rządzące ich strukturą, dynamiką i funkcją. W szczególności, badamy oddziaływania pomiędzy samymi cząsteczkami a środowiskiem wodnym, analizujemy rolę związanych cząsteczek wody i opracowujemy nowe podejścia teoretyczne do opisu hydratacji makrocząsteczek. Interesuje nas również struktura i funkcja poszczególnych układów biomolekularnych, takich jak kinazy białkowe czy peptydy aktywne błonowo.

description of research interests:

I lead a theoretical group located at the Centre of New Technolgies (CeNT">http://www.cent.uw.edu.pl/">CeNT), University of Warsaw. We apply physical models to describe and simulate biological molecules in order to gain insight into principles governing their structure, dynamics and function. We are focussing on the interplay between the molecules themselves and aqueous environment they live in. To this end, we are studiyng conformation dependent protein hydration free energies, investigate the role buried water molecules, and develop new theoretical approaches to describe macromolecular hydration. We are also interested in structure and function of particular biomolecular systems such as protein kinases or membrane active peptides.

Realizowane projekty:

Oddziaływanie peptydów fuzyjnych wirusa grypy z błonami lipidowymi.
Struktura i dynamika kinaz białkowych.
Siły napędowe w procesie zwijania chignoliny.
Rozwój dyskretnego modelu hydratacyjnego.
Analiza przyczynowości w układach biomolekularnych.

research projects implemented:

Interaction of influenza virus fusion peptide with lipid bilayer.
Structure and dynamics of protein kinases.
Biomolecular driving forces in chignolin folding.
Development of semi-explicit hydration model.
Causality analysis in biomolecular systems.

USOSweb

Słowa kluczowe:

biofizyka teoretyczna, symulacje biomolekularne, efekty hydratacyjne, struktura i dynamika białek

Key words:

theoretycal biophysics, biomolecular simulations, hydration effects, protein structure and dynamics

Contact:

show


« Back