dr hab. Dorota Latek adiunkt
Wydział Chemii
Field of study:
biological sciences, chemical sciences
Zainteresowania badawcze:
Zajmujemy się przewidywaniem struktur białek transbłonowych metodami modelowania porównawczego i de novo, badaniem dynamiki i mechanizmów ich działania. We współpracy z IRIBHM projektujemy nowe substancje o znaczeniu farmakologicznym oraz zajmujemy się optymalizacją ich struktury i właściwości w celu poprawy selektywności i minimalizacji niepożądanych reakcji polekowych. We współpracy z UPF badamy dynamikę kompleksów receptorów z GTPazami oraz sposoby przekazywania informacji do wnętrza komórki wykorzystujące m.in. ścieżki sygnałowe receptorów GPCR. We współpracy z UMP rozwijamy metody AI w projektowaniu leków działających selektywnie na dany podtyp receptora. Zajmujemy się również badaniem mechanizmów oporności na leki przeciwbakteryjne, przeciwwirusowe i przeciwnowotworowe. W obszarze naszych zainteresowań jest również rozwijanie aplikacji internetowych do wyznaczania struktur białek oraz do projektowania leków w fazie przedklinicznej.
description of research interests:
We are interested in structure prediction of transmembrane proteins using comparative and de novo modeling methods, and also in their dynamics and mechanisms of action. In cooperation with IRIBHM, we design new active substances for pharmacotherapy, we optimize their structures and properties in order to improve their selectivity and minimize adverse drug reactions. In cooperation with UPF, we study the dynamics of receptor complexes with GTPases and mechanisms of signal transduction, e.g., in GPCR signaling pathways. In cooperation with the UMP, we develop AI methods in the design of drugs that could selectively influence the signal transduction associated with a given receptor sub-type. We also study the mechanisms of resistance to antibacterial, antiviral and anticancer drugs. Our interests also include the development of web applications for protein structure determination and drug design in the pre-clinical phase.
Realizowane projekty:
Rozpoczęliśmy rekrutację do projektu OPUS 20 NCN: "Systemy samouczące w projektowaniu związków modulujących aktywację receptorów GPCR".
research projects implemented:
We have started recruiting to OPUS 20 NCN: "Self-learning systems in the design of compounds modulating GPCR receptors activation".
Słowa kluczowe:
projektowanie leków, uczenie maszynowe, dynamika molekularna, receptory GPCR, białka transbłonowe, modelowanie porównawcze, modelowanie de novo
Key words:
drug design, machine learning, molecular dynamics, GPCR receptors, transmembrane proteins, comparative modeling, de novo modeling
Contact:
Odnośniki:
Links:
« Back